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生物冷冻电镜大数据中的高效处理方法

2016-10-17 11:15:08  

报告摘要:

  近年来,随着成像设备和处理方法的飞速发展,冷冻电镜三维重构技术已成为确定生物大分子三维结构的第一选择,生物学家利用冷冻电镜解析了大量生物大分子的高分辨率三维结构。我国已具有全世界最先进和最大规模的冷冻电镜硬件实施,这些设施每天都在产生海量的生物大数据。如何对冷冻电镜大数据进行高效处理已成为计算科学所面临的关键科学问题。本报告将从科学计算的角度讨论冷冻电镜数据处理中的科学问题,并介绍本领域最近的研究成果。

报告人简介:

  张法,博士,中国科学院计算技术研究所副研究员,博士生导师。CCF生物信息学专业组委员,秘书长。中国生物物理学会冷冻电镜显微学分会理事。2002-2005年,作为国际交换学生在美国俄亥俄州立大学(Ohio State University)客座访问,2009-2010年,在西班牙胡安卡洛斯国王大学(Universidad Rey Juan Carlos)进行客座访问。

  长期从事生物信息学和高性能计算方面的研究,目前主要从事生物大分子冷冻电镜三维重构方面的研究。作为项目负责人和主要参与人主持和参与了多项国家自然科学基金重点项目、国际合作重大项目、中科院知识创新重大项目、中科院战略性先导项目(B类)等多项国家项目,作为第一作者或通信作者在国内外著名期刊和国际会议上发表论文60余篇。开发完成了国内首款冷冻电镜三维重构系统AuTOM,其中电子断层数据对位软件Markerauto 和三维重构软件ICON已成为本领域知名软件,帮助生物学家取得了重要的生物学发现。

报告时间:2016年10月26日下午

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